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化學消毒就是靠化學消毒劑，通常是用氯、氯胺、二氧化氯或是臭氧這種強氧化性物質(zhì)，然后跟微生物相互作用，達到殺毒的目的。好處是殺毒效果很好，持續(xù)時間長。壞處是只部分有效，就是對細菌和病毒很有效，但是對原蟲（隱孢子蟲，賈第鞭毛蟲等）的效率低。
此外，化學消毒本身有副產(chǎn)物，會帶來一些不好的影響。比如化學消毒劑本身要放到水里，如果用量過大會帶來污染，副產(chǎn)物也會影響水的口感，味道等。
紫外線消毒器的優(yōu)點：
1、高效率殺菌：紫外線對細菌、病毒的殺菌使用一般在一至二秒即可達到99%－99.9%的殺菌率。
2、高效殺菌廣譜性：紫外線殺菌的廣譜性是最高的，它對幾乎所有的細菌、病毒都能高效率殺滅。
3、無二次污染：紫外線殺菌不加入任何化學藥劑，因此它不會對水體和周圍環(huán)境產(chǎn)生二次污染，不改變水中任何成分。
4、運行安全、可靠：傳統(tǒng)的消毒技術(shù)如采用氯化物或臭氧，其消毒劑本身就是屬于劇毒、易燃的物質(zhì)，而紫外線消毒系統(tǒng)不存在這樣的安全隱患。
5、運行維護費用低：紫外線殺菌設(shè)備占地小，構(gòu)筑物要求簡單，因此總投資較少，在運行方面成本也較低，在千噸水處理量水平，它的成本只是氯消毒的1/2。
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